澳门皇冠的前身是宁夏师范学院、宁夏农学院和宁夏医学院，创建于1958年9月。1962年9月30日，三院合并正式成立了澳门皇冠。
1970年、1971年，宁夏医学院、宁夏农学院先后从澳门皇冠分出单独设院。澳门皇冠实际上是在原师范学院的基础上发展起来的。
1997年12月26日，澳门皇冠与宁夏工学院、银川高等师范专科学校（含宁夏教育学院）四校合并组建新的澳门皇冠。
2001年11月，教育部正式同意澳门皇冠与宁夏农学院合并组建新的澳门皇冠，并于2002年 2月26日正式挂牌成立。
2004年,澳门皇冠成为宁夏回族自治区人民政府与教育部共建高校；2008年9月，澳门皇冠成为国家“211工程”重点建设高校；2017年9月，澳门皇冠获批国家一流学科建设高校；2018年2月，澳门皇冠成为教育部与宁夏回族自治区人民政府合建高校。
